PubMed / Europe PMC
PubMed 是美国国家医学图书馆的生物医学文献数据库。ScholarMuse 并不直接调用 PubMed 的接口，而是查询 EMBL-EBI 运营的 Europe PMC。Europe PMC 收录了 PubMed 的记录，以及 PubMed Central 和预印本。agent 可以按关键词检索，也可以用 PMID、PMCID 或 DOI 查单篇论文。
对应的 ScholarMuse 工具：search_papers、get_paper。每次成功调用都会扣积分。
可以这样问你的 agent
你的 agent 会拿到什么
每条记录都带有 id、source、title、url、license、attribution 和 retrievedAt。下面是来自 PubMed / Europe PMC 的数据字段。
search_papers
默认检索。查询范围是整个 Europe PMC，所以结果可能包含预印本和不在 PubMed 中的记录。
- doi
- DOI（小写）
- pmid
- PubMed ID
- pmcid
- PubMed Central ID
- authors
- 作者或团体名称，最多 12 位
- year
- 发表年份
- date
- 首次发表日期
- venue
- 期刊名称
- type
- 文献类型，或 preprint
- citedBy
- Europe PMC 统计的被引次数
- retracted
- 文献类型含 Retracted Publication 时为 true
- openAccessUrl
- 开放获取或可公开阅读的全文链接，优先 PDF
- abstract
- 摘要，最多 2000 个字符
get_paper
PMCID 直接查 Europe PMC。PMID 和 DOI 会先查 OpenAlex，OpenAlex 没有记录时才由 Europe PMC 回答。
- doi
- DOI（小写）
- pmid
- PubMed ID
- pmcid
- PubMed Central ID
- authors
- 作者或团体名称，最多 12 位
- year
- 发表年份
- venue
- 期刊名称
- volume
- 卷
- issue
- 期
- pages
- 页码信息
- citedBy
- Europe PMC 统计的被引次数
- openAccess
- 属于开放获取或有可公开阅读的全文时为 true
- abstract
- 摘要，最多 2000 个字符
覆盖范围
- Europe PMC 收录的生物医学和生命科学文献：PubMed 记录、PubMed Central 文章和预印本。
- 检索可按发表年份区间筛选，也可只看开放获取的记录。
- 单篇查询支持 PMID、PMCID 和 DOI。
限制
- search_papers 每次最多返回 25 条，这是所有来源合计的上限。
- PMID 需写成 pmid:12345 或 pubmed.ncbi.nlm.nih.gov 的链接，只写数字不会被识别。
- 不返回 MeSH 主题词、作者单位、基金信息和全文，只返回上面列出的字段。
- verify_references 不查询 Europe PMC，引文中的 PMID 是通过 OpenAlex 解析的。
ScholarMuse 怎么访问 PubMed / Europe PMC
连接器调用 ebi.ac.uk 上的 Europe PMC 检索服务，而不是 NCBI 的 E-utilities，不发送 API key。按 PMID 查询时，会在 Europe PMC 的 PubMed（MED）记录中查找该编号。
检索结果最多缓存 6 小时，单篇查询最多缓存 1 天。此外，PubMed 的新记录进入 Europe PMC 本身也需要一些时间。
API key：不需要，数据经由 Europe PMC REST API 获取。
许可与署名
许可：Bibliographic metadata free to reuse; abstracts and full text stay under publisher or author copyright
Data from Europe PMC (europepmc.org), which includes PubMed (US National Library of Medicine).
来自 PubMed / Europe PMC 的记录都带这段许可和署名。 在论文里引用时，请按 PubMed / Europe PMC 自己的引用要求来写。
