Crystallography Open Database
Crystallography Open Database（COD）是开放获取的实验测定晶体结构库，网址 crystallography.net。通过 ScholarMuse，agent 可以按精确化学式、精确的元素组合或 COD id 找到条目，拿到晶胞参数、空间群、文献出处和 CIF 文件链接。COD 响应较慢，一次查询经常要一分钟甚至更久。
对应的 ScholarMuse 工具：lookup_material。每次成功调用都会扣积分。
可以这样问你的 agent
你的 agent 会拿到什么
每条记录都带有 id、source、title、url、license、attribution 和 retrievedAt。下面是来自 Crystallography Open Database 的数据字段。
lookup_material
source 为 cod 的记录，是实验衍射结构，不含能量和带隙。
- materialId
- 带 cod- 前缀的 COD id
- formula
- COD 中存储的化学式（Hill 记法）
- name
- 矿物名、俗名或化学名
- spacegroup
- 空间群符号
- spacegroupNumber
- 空间群编号
- crystalSystem
- 晶系，由空间群编号推出
- lattice
- a、b、c、alpha、beta、gamma 和晶胞体积
- formulaUnitsPerCell
- Z，每个晶胞的化学式单元数
- cellTemperatureK
- 晶胞测定温度（K）
- reference
- 作者、标题、期刊和年份，最多 400 个字符
- doi
- 来源文献的 DOI
- cifUrl
- CIF 文件链接
覆盖范围
- COD 中实验测定的晶体结构，每条都带文献出处和 CIF 链接。
- 可按精确化学式、1 到 8 个元素符号的列表（恰好由这些元素组成的结构）或 7 位 COD id 查询。
- 在同一个工具里与 Materials Project、OQMD 互补：那两个给计算能量，COD 给实测结构。
限制
- 很慢。COD 经常要 10 到 40 秒才响应；每次尝试最长等 55 秒，最多尝试 2 次，所以一次查询可能要一分钟甚至更久。
- 使用 stable_only 时会跳过 COD，因为 COD 没有可用来判断稳定性的能量数据。
- 化学式是精确匹配，查 TiO2 找不到 Ti2O4 或掺杂变体；不支持按矿物名、作者或空间群检索。
- 每次最多返回 30 个条目（默认 10 个），这个上限与 Materials Project、OQMD 共用。CIF 只给链接，不返回文件内容。
ScholarMuse 怎么访问 Crystallography Open Database
连接器直接请求 crystallography.net/cod/result，并指定 format=json。化学式会先改写成 Hill 记法，因为 COD 就是这样存储的。不发送任何 API key。
响应最多缓存 7 天，所以重复查询会很快，而新收录的结构可能要过这么久才能看到。
API key：上游 API 不用 key 也能调用，你不用申请。
许可与署名
许可：CC0-1.0
Data from the Crystallography Open Database (crystallography.net), public domain (CC0). Cite the original publication given with each entry.
来自 Crystallography Open Database 的记录都带这段许可和署名。 在论文里引用时，请按 Crystallography Open Database 自己的引用要求来写。
